বঙ্গবন্ধুর মূল রাজনৈতিক দর্শন ছিল পরিপূর্ণ অসাম্প্রদায়িক, সব ধর্মের মানুষের সমান সুযোগ সৃষ্টিকারী, প্রগতিশীল একটি রাষ্ট্র গড়া। তাই ১৯৪৯ সালে আওয়ামী মুসলিম লীগ প্রতিষ্ঠায় ভূমিকা রাখলেও তিনি সর্বদাই দলটির অসাম্প্রদায়িকীকরণের জন্য কাজ করতেন। এর ধারাবাহিকতায় তাঁর উদ্যোগে ১৯৫৫ সালে অসাম্প্রদায়িক রাজনৈতিক দল হিসেবে "পূর্ব পাকিস্তান আওয়ামী লীগ" গড়ে তোলা হয়। ফলে ধর্ম-বর্ণ নির্বিশেষে সবাই দেশের কাজে অংশ নেওয়ার সুযোগ পায়। এর মাধ্যমে বঙ্গবন্ধু অসাম্প্রদায়িক বাংলাদেশ প্রতিষ্ঠার লক্ষ্যে এক ধাপ এগিয়ে যান।