বাংলাদেশে ইলিশের ছয়টি অভয়াশ্রম রয়েছে। সবগুলোই মেঘনা নদী ও এর অববাহিকা এবং পদ্মা ও মেঘনার সংযোগস্থলে অবস্থিত। যথা-
-
Shatnol and Char Alexander in Meghna River, Chandpur and Lakshmipur district
-
Shahbazpur channel of the Meghna River, Bhola and Noakhali district
-
Tentulia River, Bhola and Patuakhali district
-
Andharmanik River near the Bay of Bengal, Patuakhali district
-
Estuary of Padma and Meghna Rivers, Shariatpur district.
-
Hijla and Mehendiganj in Barisal district.