অ্যান্টিবায়োটিক আসলে বিভিন্ন সংক্রমক রোগের চিকিত্সায় - যেমন ব্যাকটেরিয়া, প্যারাসাইট এবং ছত্রাকের microorganisms এর আক্রমণ এর বিপরীতে প্রয়োগ করা হয়। কিন্তু ভাইরাল সংক্রমণের চিকিত্সায় এর কোন কার্যকারিতা নেই। তাই অ্যান্টিবায়োটিক গ্রহণের পূর্বে রোগীর সমস্যাটি ব্যাকটেরিয়াজনিত নাকি ভাইরাসজনিত তা ভালভাবে নির্ধারণ করা অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ। বিশেষ করে হাড়ের চিকিত্সার জন্য অস্ত্রোপচার এবং পেটের চিকিত্সার জন্য অস্ত্রোপচারের আগে অ্যান্টিবায়োটিক দেওয়া হয় যা শরীরের ঝুঁকিপূর্ণ ইনফেকশন প্রতিরোধে প্রতিষেধক (প্রফিল্যাকটিক) হিসেবে কাজ করে ।